Top
Background image


منصة المعلوماتية الحيوية

لمحة عامة


ستعتمد منصة المعلوماتية الحيوية على مجموعة من التقنيات الأساسية. وستعمل ركيزة البنية التحتية على تطوير موارد حاسوبية أساسية، بما في ذلك قدرات حوسبة عالية الأداء تُدار بالتنسيق مع قسم تقنية المعلومات في كاوست ومختبر العلوم الحيوية الأساسي.

ستعمل هذه الركيزة أيضًا على إنشاء خوادم ويب لتقديم خدمات المعلوماتية الحيوية، بالإضافة إلى إعداد قواعد بيانات لدعم تدفّقات العمل البحثية المتنوعة. ويرتكز الجانب الأساسي فيها على بناء بنية تحتية تمكّن من إدارة البيانات وفق مبادئ FAIR، بما يضمن أن تكون البيانات قابلة للإيجاد، والوصول، والتشغيل البيني، وإعادة الاستخدام، إلى جانب وضع سياسات خاصة بالوصول والأرشفة والتخزين. br>
ستستخدم المنصة أيضًا الذكاء الاصطناعي، بالإضافة إلى الأساليب الحسابية والإحصائية، لتحليل مجموعات البيانات البيولوجية الضخمة والمعقدة الناتجة عن التقنيات الحيوية المتقدمة. وسيرّكز قطاع البحث والتطوير على ابتكار أساليب جديدة ونهج تعتمد على الذكاء الاصطناعي في مجالات متطورة، مثل تحليل الميكروبيوم والميتاجينوميات، والتحليل الجينومي المكاني، ومعالجة بيانات تسلسل النانوبور، وعلم الأحياء البنيوي.

ستعمل المنصة على تطوير وتوحيد سير عمل المعلوماتية الحيوية، باستخدام الأتمتة لتبسيط تحليل البيانات الروتيني وتحسين الكفاءة، لا سيما لمختبر العلوم الحيوية الأساسي. وتشمل الرؤية طويلة المدى مواصلة الاستثمار في الموارد الحاسوبية المتقدمة وتطوير أدوات وتطبيقات جديدة للمعلوماتية الحيوية.

البنية التحتية في المنصة


تتكون منصة المعلوماتية الحيوية من ثلاث ركائز: البنية التحتية، والخدمة، والبحث والتطوير.

نشئ ركيزة البنية التحتية قاعدة المعلوماتية الحيوية الأساسية في كاوست، بما في ذلك الموارد الحاسوبية، وخوادم الويب المُزودة بخدمات المعلوماتية الحيوية، وقواعد البيانات المُنسقة لسير العمل الرئيسي. وبالتنسيق مع قسم تقنية المعلومات والمختبر الرئيسي للحوسبة الفائقة، تضمن هذه الركيزة توافر الموارد اللازمة وصيانتها ومواءمتها مع مبادئ FAIR. وستتوافق سياسة الوصول إلى البيانات وأرشفتها وتخزينها مع سياسة البيانات في الجامعة. وسيعمل الفريق بشكل وثيق مع المختبرات الرئيسية، ويحظى بدعم من مكتب نائب الرئيس للأبحاث (VPR).

قدّم ركيزة الخدمات الدعم في مجال المعلوماتية الحيوية وتحليل البيانات لأعضاء هيئة التدريس والمختبرات الأساسية في كاوست، وخاصةً مختبر العلوم الحيوية الأساسي. وتهدف إلى أتمتة المهام الروتينية باستخدام أدوات ركيزة البنية التحتية لتحسين الكفاءة. سيُشكّل الموظفون فرقًا متخصصةً مُتوافقةً مع الأبحاث التي يقودها أعضاء هيئة التدريس لتقديم تحليلات تنافسية دوليًا، وسيُطبّقون الأساليب المناسبة التي يُطوّرها أعضاء هيئة التدريس.

تضم ركيزة البحث والتطوير باحثين مستقلين في مناصب أعضاء هيئة التدريس أو كبار العلماء، يتعاونون مع أعضاء هيئة التدريس في كاوست في مشاريع المعلوماتية الحيوية والذكاء الاصطناعي. قد تشمل مجالات التركيز تحليل الميكروبيوم، وعلم الجينوم الميتاجينومي، وعلم الوميكس المكاني، وتسلسل النانوبور، وعلم الأحياء البنيوي. ويتلقى العاملون في هذا القطاع دعمًا من مشاريع ممولة داخليًا أو خارجيًا، مع فترة انتقالية مدتها عام ونصف مدعومة من مكتب نائب الرئيس للأبحاث (VPR). ويمكن لأعضاء الفريق الانضمام إلى مشاريع تعاونية، والحصول على تمويل خارجي، والسعي وراء فرص مثل التدريس أو التدريب من خلال برامج متميزة مثل أكاديمية كاوست.

خبراء المنصة



  • أعضاء هيئة التدريس التابعين للمنصة
  • طاقم الفريق
Gao البروفيسور شين غاو
رئيس المنصة
قسم علوم الحاسوب
Pain البروفيسور أرناب باين
العلوم البيولوجية
Arold البروفيسور ستيفان أرولد
العلوم البيولوجية
mo li البروفيسور مو لي
العلوم البيولوجية
Nicole الدكتورة نيكول تشيونج
مديرة مختبر العلوم البيولوجية الأساسية
Tareq Al-Naffouri البروفيسور ديفيد غوميز كابريرو
العلوم البيولوجية (عضو مكلف)
Shehab Ahmed آلان كاماو
أخصائي إدارة قواعد البيانات
Dana Al-Sulaiman محمود أولوداغ
كبير علماء تطوير البرمجيات في مجال المعلوماتية الحيوية
Dana Al-Sulaiman محمد سيف
مدير أنظمة أول
Tareq Al-Naffouri الدكتور سليم بوغوفا
كبير علماء الأحياء الحاسوبية

الخبرات البحثية

تبسيط دعم المعلوماتية الحيوية لـ مختبر العلوم الحيوية الأساسي (BCL)

+

توحيد سير العمل

+

تعزيز البحث والتطوير في مجال الميتاجينوميات

+

التمويل والدعم الخارجي

+

Contact Us

For media inquiries, please contact global.pr@kaust.edu.sa