Top

سمير حمدان

‪ عميد مكلف, قسم العلوم والهندسة البيولوجية والبيئية
أستاذ مشارك, العلوم البيولوجية

قسم العلوم والهندسة البيولوجية والبيئية


الانتماءات

المؤهل العلمي

  • ​دكتوراه في الكيمياء من كلية الأبحاث الكيميائية، جامعة أستراليا الوطنية، كانبيرا، 2002
  • ماجستير علوم في الكيمياء من جامعة ويسترن متشجن، 1998
  • بكالوريوس علوم من جامعة اليرموك، الأردن، 1995

الاهتمامات البحثية


تجمع اهتمامات البروفيسور حمدان البحثية بين الكيمياء البيولوجية والفيزياء البيولوجية والأدوات الهيكلية مع أساليب الجزيئيات المفردة لغرض فهم آليات الجزيئيات الكامنة في آلية استنساخ الحمض النووي متعدد البروتينات ومواقع نواة الخلية المحتوية على سلسلة الأنزيمات وتفاعلها مع أزواج الحمض النووي وانفصال واعادة التحام خطوط الحمض النووي.

وقد أدت القدرة على ملاحظة النشاطات الأنزيمية في الوقت الحقيقي على مستوى الجزيئ المفرد إلى تغيير هائل في طريقة دراسة التفاعلات البيوكيميائية.

ومن خلال إلغاء متوسط المجموع فإن توزيعات وتذبذب الخواص الجزيئية يمكن توصيفها، أما الوسائط العابرة فيمكن ملاحظتها والتعرف عليها، فيما يمكن شرح وتفسير آليات التحفيز الكيميائي. وسيوفر تطبيق هذا الأسلوب متعدد التخصصات فهما فعليا لجزيئيات الآليات في عمليات الاستنساخ واصلاح وانفصال واعادة التحام الحمض النووي.

كما أن هذا الأسلوب يؤدي إلى تمديد تحليل الجزيئ المفرد من بروتينات جديدة إلى البروتينات المتعددة الضخمة التي تحتوي غالبا على نشاطات أنزيمية عديدة.

مؤلفات مختارة

  • Hamdan SM, Marintcheva B, Cook T, Lee SJ, Tabor S, and Richardson CC. A unique loop in T7 DNA polymerase mediates the binding of helicase-primase, DNA binding protein, and processivity factor. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA. 2005, 102(14): 5096–5101. doi:10.1073/pnas.0501637102
  • Lee J-B, Hite RK, Hamdan SM, Xie XS, Richardson CC, and van Oijen AM. DNA primase acts as a molecular brake in DNA replication. Nature. 2006, 439(7076): 621–624.doi:10.1038/nature04317
  • Hamdan SM, Johnson DE, Tanner NA, Lee, J-B, Qimron U, Tabor S, van Oijen AM, and Richardson CC. Dynamic DNA helicase-DNA polymerase interactions assure processive replication fork movement. Molecular Cell. 2007, 27(4): 539–549 doi:10.1016/j.molcel.2007.06.020
  • Hamdan SM, Loparo JJ, Takahashi M, Richardson CC, and van Oijen AM. Dynamics of DNA replication loops reveal temporal control of lagging-strand synthesis. Nature. 2009, 457(7227): 336–339. doi:10.1038/nature07512
  • Hamdan SM and Richardson CC. Motors, switches, and contacts in the replisome. Annual Review of Biochemistry. 2009, 78: 205–243.doi:10.1146/annurev.biochem.78.072407.103248
  • Sobhy MA, Joudeh LI, Huang X, Takahashi M, and Hamdan SM. Sequential and multistep substrate interrogation provides the scaffold for specificity in human flap endonuclease 1.Cell Reports. 2013, 3(6): 1785–1794. doi:10.1016/j.celrep.2013.05.001
  • Iwata Y, Takahashi M, Fedoroff NV and Hamdan SM. Dissecting the interactions of SERRATE with RNA and DICER-LIKE 1 in Arabidopsis microRNA precursor processing. Nucleic Acids Research. 2013, 41(19): 9129-40. doi:10.1093/nar/gkt667
  • Elshenawy MM, Jergic S, Xu Z-Q, Sobhy MA, Takashi M, Oakley AJ, Dixon NE, and Hamdan SM. Replisome speed determines the efficiency of the Tus−Ter replication termination barrier. Nature. 2015, 525(7569): 394–398. doi:10.1038/nature14866.
  • Rashid F, Harris PD, Zaher MS, Sobhy MA, Joudeh IL, Yan C, Piwonski H, Tsutakawa SE, Ivanov I, Tainer JA, Habuchi S, and Hamdan SM. Single-molecule FRET unveils induced-fit mechanism for substrate selectivity in flap endonuclease 1. Elife. 2017, 6.pii: e21884. doi:10.7554/elife.21884
  • Takahashi M, Takahashi E, Joudeh LI, Marini M, Das G, Elshenawy MM, Akal A, Sakashita K, Tehseen M, Sobhy MA, Stingl U, Merzaban JS, Di Fabrizio E, and Hamdan SM. Dynamic structure mediates halophilic adaptation of a DNA polymerases from the deep-sea brines of the Red sea. FASEB J. 2018. doi:10.1096/fj.201700862RR
  • Zaher MS, Rashid F, Song B, Joudeh LI, Sobhy MA, Tehseen M, Hingorani MM, and Hamdan SM. Missed Cleavage opportunities by FEN1 lead to Okazaki fragments maturations via the long-flap pathway. Nucleic Acids Research. 2018. doi:10.1093/nar/gky082
  • Sobhy MA, Bralic A, Raducanu VS, Takahashi M, Teshseen M, Rashid F, Zaher MA and Hamdan SM. Resolution of the Holliday junction recombination intermediate by human GEN1 at the single-molecule level. Nucleic Acids Research. 2019. doi:10.1093/nar/gky1280.
  • Rashid F, Raducanu VS, Zaher MS, Tehseen M, Habuchi S, and Hamdan SM. Initial state of DNA-dye complex sets the stage for protein induced fluorescence modulation. Nature Communications. 2019. doi:10.1038/s41467-019-10137-9.