انضم البروفيسور عامر فاروق إلى برنامج الهندسة الميكانيكية ضمن قسم العلوم والهندسة الفيزيائية في جامعة الملك عبدالله للعلوم والتقنية (كاوست) في عام 2010، وتولى رئاسة البرنامج من عام 2017 حتى 2024. يُعد الدكتور فاروق خبيرًا بارزًا في الحركية الكيميائية وأجهزة الاستشعار الليزرية، وقد نال العديد من الجوائز المرموقة تقديراً لمساهماته في هذا المجال. نشر أكثر من 250 مقالة علمية محكّمة، وألقى العديد من المحاضرات بدعوة من مؤتمرات دولية مرموقة. يشغل فاروق أيضًا منصب المدير المؤسس لبرنامج الابتكار التقني وريادة الأعمال (TIE) في كاوست، وهو برنامج فريد من نوعه في المملكة العربية السعودية والشرق الأوسط. ويسعى من خلاله إلى إعداد جيل جديد من رواد الأعمال وقادة الابتكار ومؤسسي الشركات الناشئة. يمنح البرنامج درجة الماجستير، ويمزج بين التخصص التقني والعقلية الريادية، ويتيح للطلبة فرصًا للتفاعل مع جهات شريكة محلياً ودولياً.​

تشمل اهتمامات الدكتور فاروق البحثية علوم الطاقة، وأنظمة الدفع، والحركية الكيميائية، والأمواج الصدمية، والمطيافية، وأجهزة الاستشعار المعتمدة على الليزر. وهو الباحث الرئيس في مجموعة فاروق لتقنيات الاستشعار المتقدمة وأبحاث الطاقة (FASTER). يركّز في أبحاثه على تطوير وأجهزة الاستشعار الليزرية لتطبيقات تشمل أنظمة الطاقة، ورصد البيئة، والتشخيصات الطبية الحيوية. ويتخصّص مختبره في تطوير وتطبيق تقنيات تجريبية متقدمة لدراسة العمليات الأساسية في أنظمة تحويل الطاقة التقليدية والمتجددة، بما في ذلك أبحاث متقدمة حول كيمياء الوقود الإلكتروني، والوقود الحيوي، والوقود منخفض الكربون، والوقود الخالي من الكربون، وذلك باستخدام أنابيب الصدمة، وآلات الانضغاط السريع، والمفاعلات التحفيزية، إضافة إلى مجموعة من تقنيات التشخيص المتطورة.​